Konta internetowe, mimo że bardzo dobre i wygodne oraz dość proste w obsłudze nie są idealne. Posiadają kilka bardziej lub mniej istotnych wad. Na pewno bardzo poważnym zagrożeniem są wirusy, mimo doskonałych współcześnie programów antywirusowych ciągle atakują one banki, a zwłaszcza konta internetowe, które są na to bardzo podatne. Trzeba pamiętać aby zawsze wylosowywać się ręcznie z banku, ponieważ może nas spotkać nieprzyjemna przygoda, i możemy stracić wszystkie dostępne środki, a chyba tego nie chcemy , prawda? Hakerzy tylko czyhają i szukają celu do ataku i na przykład kradzieży środków pieniężnych z naszego prywatnego konta internetowego. Wadą banków internetowych jest również częsty brak w małych miastach ich fizycznych oddziałów i gmachów, co uniemożliwia ludziom często kontakt z konsultantem osobiście w jakiejś ważnej sprawie. Tyczy się to głownie małych banków, ale jest to często spotykane. Więcej wad rzecz nie można wytknąć bankom internetowym , są one na pewno bardzo przyszłościowe i wygodne., wiele wad też nie posiadają.